La participación de los Laboratorios Clínicos de Puebla en actividades de investigación ha sido, desde sus inicios, sólida y sostenida. Bien a través del apoyo a tesis de licenciatura, maestría, doctorado y especialidad que se desarrollan en la institución, o mediante la participación en estudios multicéntricos, una proporción importante de los profesionales de los Laboratorios Clínicos de Puebla desarrollan, en forma regular, investigación científica clínica o experimental. La institución pertenece al Registro Nacional de Instituciones y Empresas Científicas y Tecnológicas del CoNaCyT, y algunos de sus profesionales están incorporados al Sistema Nacional de Investigadores del mismo Consejo.
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